《水产基因组技术与研究进展》具有重要的战略地位，它既是农学和生物学中不可或缺的重要领域，又是维持和提升水产产业和确保人类社会和谐发展的知识基础和技术支撑。联合国粮农组织（FAO）2008年统计表明：“水产养殖继续是动物食品生产部门增长最快的产业，其增速超过人口增长，来自水产养殖的人均供应量从1970年的0.7千克增加到2006年的7.8千克，年平均增长率为6.9％。”FAO预言：“一个里程碑可能就要出现。经过稳定增长，尤其是过去40年的稳定增长，水产养殖产量将首次占全世界人类消费水产品的一半，这不仅反映了水产养殖产业的活力，还反映了全球经济的增长以及水产品加工和贸易的持续发展。”

第一章 大片段基因组文库的构建、质量鉴定和应用
第一节 大片段基因组文库发展概述
第二节 大片段基因组文库的构建
一、HMW DNA的制备
二、HMW DNA部分酶切和片段选择
三、载体的制备
四、连接和转化
五、克隆的挑取与保存
六、目的克隆的筛选
第三节 文库的质量鉴定
一、文库插入片段的平均大小和基因组覆盖率
二、文库的空载率、嵌合率和细胞器DNA污染
三、文库的稳定性检测
第四节 大片段基因组文库的应用
一、基因和数量性状位点(QTL)的图位克隆
二、基因组物理图谱的构建
三、全基因组测序
四、功能基因组分析
五、比较基因组学研究
第五节 大片段基因组文库在水产生物基因组研究中的应用和展望

第二章 物理图谱构建技术及其在水产生物基因组研究中的应用
第一节 物理图谱构建技术
一、黏粒文库酶切指纹制备
二、BAC文库酶切指纹图谱的制备
三、物理图谱的装配
四、物理图谱的验证策略
第二节 物理图谱在基因组学研究中的应用
一、物理图谱与遗传图谱的整合
二、基于物理图谱的全基因组测序策略
三、重要基因的图位克隆
四、基于物理图谱的比较基因组学研究
第三节 物理图谱构建技术最新进展
第四节 高信息含量BAC酶切指纹图谱采集实验流程
一、BAC克隆DNA提取实验流程
二、HICF技术流程

第三章 水产生物遗传作图
第一节 作图群体的选择
一、亲本的选择
二、分离群体类型的选择
三、群体大小的选择
第二节 干涉和作图函数
一、干涉
二、作图函数
第三节 F2、BC和DH群体标记位点间重组率的估算
一、两个标记位点间重组率的估算
二、多位点连锁分析方法和排序
三、基因型分型错误率及缺失率对连锁图谱的影响
第四节 远缘杂交群体的连锁分析
一、全同胞家系分离标记的特点
二、拟测交策略
三、构建F1群体遗传连锁图谱的统计分析步骤
四、构建F1群体遗传连锁图谱的软件
第五节 遗传图谱整合
一、分子图谱之间的整合
二、物理图谱和连锁图谱整合
……

第四章 全基因组测序：水产生物基因组资源的全面开发
第五章 荧光原位杂交作图
第六章 系统发育基因组学
第七章 比较基因组学在水产生物基因组学研究中的应用
第八章 转录组尝试测序技术
第九章 生物芯片与水产生物功能基因组学研究
第十章 数字基因表达谱技术
第十一章 鱼类免疫功能基因研究
第十二章 非编码RNA
第十三章 常用分子标记
第十四章 分子遗传与保护生物学
第十五章 水产动物转基因技术
第十六章 鱼类转座子介导的转基因和基因捕获策略