前言
第一章 绪论
第一节 蛋白质组学形成的历史沿革
第二节 蛋白质组学的研究内容与技术路线
第三节 蛋白质组学在系统生物学中的地位
第四节 蛋白质组学的发展趋势
第五节 农业生物蛋白质组学的研究现状与前景
思考题
主要参考文献

第二章 蛋白质样品的全息制备
第一节 蛋白质样品裂解液成分分析
第二节 细胞裂解与蛋白质提取
第三节 蛋白质的分离与纯化
第四节 亚细胞器的分离与蛋白质提取
第五节 蛋白质样品的浓缩、干燥及保存
思考题
主要参考文献

第三章 双向凝胶电泳
第一节 双向凝胶电泳
第二节 凝胶中蛋白质检测
第三节 蛋白质印迹
第四节 图像采集与后续分析
第五节 双向电泳技术的局限性和发展方向
第六节 双向电泳中的问题与原因分析
第七节 毛细管电泳技术简介
思考题
主要参考文献

第四章 蛋白质组学中的液相色谱
第一节 高效液相色谱
第二节 反相色谱
第三节 多维液相色谱
思考题
主要参考文献

第五章 电泳图谱的图像分析
第一节 双向电泳图谱分析
第二节 双向电泳图谱分析技术要点
第三节 双向电泳数据库和网上比较
第四节 双向电泳蛋白质谱数据库构建
思考题
主要参考文献

第六章 生物质谱技术与蛋白质鉴定
第一节 生物质谱基本原理
第二节 质谱技术在鉴定蛋白质中的应用
思考题
主要参考文献

第七章 蛋白质翻译后修饰的鉴定
第一节 磷酸化蛋白质的鉴定
第二节 糖基化蛋白的鉴定
第三节 泛素化蛋白的鉴定
第四节 其他翻译后修饰
思考题
主要参考文献

第八章 定量蛋白质组学研究技术
第一节 荧光双向差示凝胶电泳技术
第二节 稳定同位素代谢标记技术
第三节 稳定同位素的体外标记方法
思考题
主要参考文献

第九章 蛋白质-蛋白质相互作用
第一节 蛋白质-蛋白质相互作用的类型与研究意义
第二节 蛋白质互作的分析原理
第三节 蛋白质免疫共沉淀
第四节 酵母杂交系统
第五节 噬菌体展示技术
第六节 蛋白质微阵列和芯片技术
第七节 串联亲和纯化技术
第八节 其他蛋白质-蛋白质相互作用研究技术简介
思考题
主要参考文献

第十章 蛋白质组生物信息学
第一节 生物信息学简介
第二节 主要相关网站和数据库
第三节 通过序列相似性搜索数据库
第四节 质谱识别蛋白质方法
思考题
主要参考文献

第十一章 蛋白质组学技术在作物科学研究中的应用
第一节 作物蛋白质组学研究的技术特点
第二节 作物遗传多样性分析
第三节 作物器官与发育生物学
第四节 作物不育性机理
第五节 作物遗传作图
第六节 作物抗病相关蛋白
第七节 作物抗胁迫相关蛋白
思考题
主要参考文献

第十二章 蛋白质组学技术在动物科学研究中的应用
第一节 动物蛋白质组学研究的特点
第二节 畜禽、昆虫遗传多样性
第三节 畜禽、家蚕生殖与发育
第四节 家蚕、害虫免疫与抗逆生理
第五节 畜禽产品质量相关性状
第六节 畜禽疾病生理
第七节 水生生物疾病生理
思考题
主要参考文献

第十三章 蛋白质组学在微生物研究中的应用
第一节 微生物蛋白质组学研究的技术特点
第二节 生物防治微生物作用机理
第三节 植物病原微生物致病相关蛋白的鉴定
第四节 食源性病原微生物相关蛋白的鉴定
第五节 微生物固氮相关蛋白
第六节 微生物环境胁迫相关蛋白的鉴定
第七节 微生物降解农业废弃物与农化物质相关蛋白的鉴定
思考题
主要参考文献