1.绪论
2.工业发酵生产线上的细胞机器
3.发酵学第一假说
3.1微生物细胞过程的热力学
3.2微生物细胞内外的物质交换
3.3化能异养型微生物的生物氧化
3.4化能异养型微生物代谢中的能量形式转换
3.5质子运动势和质子回路
3.6代谢能对微生物生长和维持的支撑
4.发酵学第二假说
4.1微生物代谢网络的中心板块
4.2微生物代谢网络的向心板块
4.3微生物代谢网络的离心板块
4.4代谢网络和联网问题
4.5代谢网络中代谢物流的形成
4.6代谢网络假说的形成和发展
5.发酵学第三假说
5.1细胞经济假说细胞经济假设的微生物学与分子生物学基础
5.2微生物细胞经济体系的运行规律
5.3代谢网络中碳架物质流的调动
5.4细胞经济假说与细胞经济学
6.发酵学基本理论框架